생물정보학과 관계된 proteomics ⊙ protein DB의 종류, 특성1. PRIDE (PRoteomics IDEntifications database)주소 http www.ebi.ac.uk pride PRIDE 소개 PRIDE (PRoteomics IDEntifications database)는 표준화 (PSI, HUPO)된 프로테옴 정보 (공개 혹은 비공개 정보)의 집중화된 저장소 (repository)이다. 본 데이터베이스는 프로테오믹스 연구 공동체에 단백질 및 펩타이드의 동정결과 및 이를 증명할 수 있는 스펙트럼 등의 순수 데이터 및 간략한 실험정보 등을 저장할 수 있는 공익목적의 저장소로 개발되었다. RIDE는 EMBL-EBI와 벨지움의 Ghent 대학과의 공동작업으로 개발하고 있으며, 초기의 개발 동기는 일반화된 데이터 교환 포맷을 제공하고, 프로테오믹스 관련 논문 출간의 저장소로 사용하기 위하여였다. 앞으로 PRIDE는 일련의 조직 관련 (tissue-based) proteome 데이터 모음의 표준을 제시할 것이다. PRIDE에서는 단백질 동정결과의 저장 뿐 만 아니라, 펩타이드의 단백질의 번역 후 변 형 (Post-translational modification) 정보도 저장 가능합니다. PDIDE 공동개발 및 운영자 EBI - 유럽연합 생물정보학 연구소, 캠브리지, 영국 Universiteit Gent - Ghent 대학교, 겐트, 벨지움 Faculty of Life Sciences, 맨체스터 대학교 - 맨체스터, 영국 연세프로테옴연구센터 - 연세대학교, 서울, 대한민국 2. wwPDB (World Wide Protein Data Bank)주소 http www.wwpdb.org ftp ftp.rcsb.org pub pdb (ftp )형식으로 DB에 접근한다. wwPDB 소개 ...
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