정부의 지역전략산업 육성사업은 크게 정부출연금으로 운영되는 R&D 성격의 사업과 지자체가 보조하는 사업으로 나뉜다. R&D 성격의 지역전략산업 육성사업은 지역별 전략산업 특화분야에 대한 중소기업 위주의 기술개발 지원사업인 지역전략산업 진흥사업(지역산업 기술개발사업)과 장기 대형 과제 및 지자체별 사업화가 필요한 과제에 대해 산학연 공동 연구개발을 지원하는 지방 기술혁신사업, 지역혁신거점 육성사업인 테크노파크 조성사업으로 구성된다. 지자체가 보조하는 지역전략산업 육성사업은 지원시설 및 장비 구축 등을 포함한 지역산업 기반 구축사업과 마케팅, 인력양성 등 기업지원 서비스사업 등이 있다. 사업 예산은 사업이 시작된 1999년부터 2010년까지 총 3조8197억원의 국비가 지원됐다. 부문별로는 인프라 구축 1조8498억원, 기술개발 1조3932억원, 기업 지원 서비스 4775억원, 전략산업기획단 운영 992억원 등이 투입됐다. 올해는 2688억원의 예산이 지원될 예정이다.
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